9月1日，香港科技大學（廣州）舉行開學典禮。廣東省委書記李希出席活動，全國政協副主席梁振英、香港特別行政區行政長官李家超發表視頻致辭，教育部部長懷進鵬、廣東省省長王偉中出席活動并致辭。
梁振英表示，香港科技大學（廣州）是重大粵港合作項目，也是國家持續改革開放的重要體現。香港科技大學（廣州）在南沙開學意義重大，標志著廣東多了一所一流大學，粵港在高等教育和科研等方面有了合作新平臺，有助于兩地更好實現跨境和跨領域的產學研合作。希望香港科技大學（廣州）在發展過程中大膽闖、大膽試，創新體制機制，促進要素流通，在推動粵港澳大灣區建設、支持香港更好融入國家發展大局中發揮積極作用。
李家超表示，香港科技大學（廣州）是《粵港澳大灣區發展規劃綱要》發布后首個獲國家教育部批準正式成立、由內地與香港合作辦學的高等教育機構，也是《廣州南沙深化面向世界的粵港澳全面合作總體方案》頒布以來首批啟用的重點項目。香港科技大學（廣州）在南沙開校，必將引領穗港教育合作開啟新篇章。希望香港科技大學（廣州）進一步發揮香港聯通世界的節點功能，與香港校園協同推動國家科技發展，培養愛國愛港具備國際視野的新一代人才。香港特區政府將繼續與廣東省政府攜手奮進，為實現中華民族偉大復興的歷史進程貢獻力量。
懷進鵬表示，香港科技大學（廣州）校園順利建成并迎來第一批學子，是一個具有里程碑意義的重要時刻，這是“一國兩制”偉大事業的生動實踐，也是教育服務粵港澳大灣區和國家建設的具體體現。希望香港科技大學（廣州）堅持正確辦學方向，落實立德樹人根本任務，厚植培養胸懷“國之大者”的人才沃土，擔當粵港澳科技創新的智慧引擎，搭建內地與香港青年交流的橋梁紐帶，努力成為扎根中國、融通粵港、面向世界的新時代合作大學的標桿與示范。
王偉中表示，香港科技大學（廣州）建成開學，是在習近平總書記、黨中央親切關懷下，粵港澳大灣區建設取得的又一重要成果，必將進一步增強港澳青年對祖國的向心力，給廣東推進粵港澳大灣區高水平人才高地建設、給廣州提升高等教育發展水平、給南沙深化面向世界的粵港澳全面合作，注入新的活力動力。廣東將全力支持學校建設發展，助力我國高等教育綜合改革，促進內地與香港教育融合發展，為推進粵港澳大灣區建設、服務“一國兩制”偉大實踐作出更大貢獻。
開學典禮由香港科技大學（廣州）校長倪明選主持，省領導林克慶、張虎、王曦、張曉強，廣州市市長郭永航參加活動。
